Six mois on passé depuis la défaite d'Edea devant la galaxie entière. Six mois que l'empire CID a été créé. Zanarkand, après les violent combat qu'elle a subie, se reconstruit peu a peu.

Les différentes guildes on tous rejoint le nouvel Empire. Des Trétians, des Seed et plein d'autres, tous sous les ordres de Vincent Valentine, le Tueur de Dieux...

Pour la galaxie entière, Vincent est un maitre Sith de l'ancien temps, capable d'utiliser la Force.

Mais une menace se profile a l'horizon...
Des rumeurs disant que d'autre comme lui, portant les mêmes armes et ayant les même pouvoirs, s'affronte un peu partout avant de disparaitre...

Après des centaines d'années, le Soulèvement de la Force va commencer !!